PC Toledo

Tenho a versão hb34 e estou a usar a função WAPI_MESSAGEBOX para as mensagens, mas às vezes a mesma fica por trás da aplicação.
Já aconteceu a mais alguém?

Justamente o primeiro parâmetro indica a qual janela MessageBox() está vinculada.
Se o parâmetro for zero, significa que não está presa a janela nenhuma.
Aí deve ser colocado o hWnd, o handle da janela.
Verifique em sua LIB gráfica como obter esse handle.