Comentário:Vou postar aqui a solução, pois pode ajudar a outros que venham a passar por isso.
Como eu disse, o nosso software usa as dlls da TKS para a geração, envio, cancelamento e inutilizaçao da NFe,
e eu não sei o porque, mas não era preciso instalar o certificado A3 na maquina do usuario, bastava apenas inserir
o leitor no USB e deixar o windows reconhecer. Com o componente da ACBr não é assim, nos precisamos instalar o
certificado através do software proprio de cada empresa emissora do certificado (no caso do nosso cliente a Serasa),
e com um detalhe importante, tem que se logar na maquina como administrador. Apos a instalação, bastou registrar
as Dlls (capcon etc), que funcionou perfeitamente.
Apesar do certificado estar instalado no Windows, isso não elimina a necessidade do certificado físico, já que é A3.
E por necessitar o certificado físico, depende de tudo relacionado à segurança e comunicação até ele.
Sinceramente, não faço a menor idéia de como isso funciona, ou do que depende pra funcionar.
O A1, uma vez instalado no Windows, não precisa de nada adicional.
